Всеукраїнську Раду Церков і релігійних організацій (ВРЦіРО) утворено наприкінці 1996 року як міжконфесійну інституцію. Метою діяльності ВРЦіРО є об’єднання зусиль конфесій у справі духовного відродження України та координації міжцерковного діалогу як в Україні, так і за її межами, а також участь у розробленні проєктів нормативних актів із питань державно-конфесійних відносин та здійснення комплексних заходів доброчинного характеру.
Рада Церков функціонує на засадах рівності та рівноправ’я, поваги до внутрішніх настанов і традицій усіх релігійних організацій, що діють у межах законодавства України, та є незалежною від органів державної влади, політичних партій, інших громадських формувань та їхніх керівних органів.
Станом на червень 2021 року до складу ВРЦіРО входять 15 церков і релігійних організацій та 1 міжцерковна організація, серед яких православні, греко- і римсько-католицька, протестантські та євангельські церкви, а також іудейське та мусульманське релігійні об’єднання. Відтак Рада Церков представляє більш як 95 % усіх релігійних організацій України.
Згідно з Положенням, головування у ВРЦіРО члени Ради здійснюють почергово. Ротація головуючого у Раді Церков відбувається щопівроку. Це допомагає розподілити між конфесіями відповідальність за поточну координацію діяльності ВРЦіРО, її Секретаріату та профільних комісій.
Секретаріат ВРЦіРО, що складається з представників кожної конфесії, створено 2005 року для попереднього опрацювання актуальних питань перед їх винесенням на засідання для розгляду членами Ради. Також у складі ВРЦіРО функціонують профільні групи – Комісія з питань соціального служіння, Комісія медіа служіння та Робоча група з питань реституції майна релігійних організацій.
У липні 2019 року відбулася державна реєстрація ВРЦіРО як громадської спілки. Засновниками виступили церкви і релігійні організації, які входять до її складу.